工程预算中的工程结算审核，以施工承包合同为基础．以承发包双方发生的实物交易为依据，按照 或地方施工工、料、机消耗标准进行核算，对双方有约束力。其工程结算审核结果可作为双方结算的法律依据。审计定义为：由独立的机构和人员检查被审计单位的会计凭证、会计帐本、会计报表以及其他与财政收支、财务收支有关资料和资产，监督财政收支、财务收支是否真实、合法和有效的行为。审计的目的是加强对公有制投资者资金进行有效的控制，减少投资者滥用职权截留资金，转移资金于小金库，造成建设资金流失，实施违法违规行为。其职能是一种监督行为。
在竣工阶段，存在的 问题就是结算书编制不科学，经常出现冒算多算、高套取费标准、高套定额单价等现象，使得工程预算。在编制招标文件和相关合同时，在其中明确差额标准。比如，施工单位上报的竣工结算预算允许和审计核定预算存在一定的差额，但是这个差额不能超过10%，否则就要由施工单位承担超出部分的审计费用，并且对其进行罚款。在审计时可以同时聘请两家审计单位进行审计工作，对两次审计结果进行对比，以控制审计质量。如果两家的审计结果存在差额，这个差额应控制在一定范围内。通过这样的方法保证审计质量，减少审计的负面影响。此外，新余工程预算在审计的过程中还要加强以下几个方面的审查：①投标承诺的让利是否到位；②工程量是否真实性；③材料报价是否真实；④签证单是否真实；⑤取费标准是否合理。市政工程预算控制是一个动态的过程，不同的施工阶段其预算控制方法也不同，因此，在市政工程开展的过程中，要根据每个施工阶段预算控制容易出现的问题，采取针对性的措施予以解决，以保证市政工程预算控制的科学行和合理性，以降低工程成本，帮助企业在保证工程质量的前提下获取经济效益。
分包工程竣工结算审计是分包工程全过程跟踪审计的第三步，是对分包工程预算的终确定。分包工程预算的合理性和准确性，直接体现着分包工程的审计质量和审计成果严格复核结算工程量。对结算工程量要严格审查和准确计算，将工程量的计算及变更签证的确认作为审计重点，注意工程量的重复和多计，增强对虚假变更签证的辨别力。工程量的确定要依据施工图和业主或建设单位签发的公务通知单、设计部门的设计变更单。尤其对现场变更工程量的确认，严防只计增不计减，要把握住“在一般情况下，有增必有减”的原则，如果有增无减，就要查明原因。对野外偏僻的施工签证，要有现场各级人员的签认，否决“一言堂”签证。
如何控制建设项目的工程造价？实施全过程工程监理是一个有效途径。建设监理制作为科学的建设项目管理方法，主要是以 政策、技术规范、定额、合同等为依据，跟踪控制设计过程和施工过程的投资、工期和质量，确保三大目标的实现。监理的特殊身份，决定了其行为的客观性、科学性，新余工程预算决定了其实施投资控制的合理性、有效性。工程监理可以在项目建设的各阶段，通过科学的管理和有效的控制来实现业主控制工程造价的目标。实践表明，要使工程监理在控制工程造价中发挥关键作用，必须分别从设计、招标、施工、竣工各个阶段入手，持续、地进行严格而有效的监理。加强设计阶段的监理，确定合理的设计方案、新余工程预算成熟的工艺，减少在施工阶段重大设计变更和方案变化的发生，对有效控制工程造价将起到重要作用。据资料统计，影响项目投资的 阶段是设计阶段，影响项目投资的可能性为75%.设计阶段如能以经济效益为中心，精打细算，则节约投资的潜力要比施工阶段大得多。新余工程预算所以搞好设计阶段的工程造价控制是有效控制“投资失控”的首要任务。